Flee est l'histoire vraie d'un homme qui doit se confronter à son passé pour espérer avoir un avenir. Amin 16 ans, est arrivé seul au Danemark en provenance d'Afghanistan. Aujourd'hui, à 36 ans, il est un universitaire reconnu et sur le point de se marier avec son petit ami. Mais un secret qu'il cache depuis 20 ans menace de ruiner la vie qu'il s'est construite. Pour la 1ère fois, il partage son histoire avec son meilleur ami.