Désormais hôtes de la Reine des Amazones, Esteban et ses amis découvrent éblouis la luxueuse pièce où ils logeront durant leur séjour dans la Cité. Toutefois, Paola leur précise qu'ils ne pourront en sortir sans escorte. Mendoza ne peut se résoudre à un tel destin et veut échapper à leur surveillance, par n'importe quel moyen.
Pendant ce temps les trois enfants font la rencontre de Morka, jeune servante et favorite de la Reine. Celle-ci vient leur proposer à boire, mais tous remarquent l'anxiété de la jeune fille qui fait maladroitement tomber son plateau pour finalement fondre en larmes. Elle supplie Esteban de venir à son secours : en effet, la perfide Omuro souhaite l'offrir en sacrifice, à la place des trois enfants. Toutefois Morka n'est pas dupe et sait qu'Omuro est profondément jalouse du pouvoir de la Reine. Elle connaît également la puissance de la prêtresse, qui possède le pouvoir de prédire la Pluie et de communiquer avec le dieu. Troublé par cette révélation, Tao souhaite se rendre dans le temple du dieu de la pluie pour éclaircir les dires de Morka. Là, tous découvrent le totem du dieu. Mais l'oeil scientifique de Tao y repère également un hydromètre, curieux outil météorologique permettant de connaître la pression atmosphérique.
De son côté, Mendoza prévient Esteban qu'il a trouvé un moyen de s'échapper. A contre coeur, les enfants le suivent et parviennent à passer le mur d'enceinte de la Cité. Armés d'une hache, nos amis rejoignent le fleuve, construisent un radeau de fortune et tentent de rejoindre le Grand Condor. Mais malgré leurs efforts, le serpent géant parvient à détruire le radeau. Soudain une lance atteint le serpent en pleine tête et le tue, alors qu'il s'apprêtait à fondre sur Esteban et Zia. Tous découvrent que depuis la rive, Paola vient de sauver la vie des deux enfants. Mais Omuro a sournoisement observé la scène et accuse Paola d'avoir mis en péril toute la tribu. En effet, cet anaconda sacré protégeait les Amazones des Seibans, leur tribu ennemie. Devant la Reine, Paola se défend et affirme qu'elle a simplement protégé la vie du Fils du Soleil.
Un peu plus tard, Omuro lance de sinistres prédictions : la tempête est sur le point de s'abattre sur la cité. Cependant, les choses tournent mal pour elle. En effet, le mécanisme lui permettant de prédire la pluie change brutalement de prévision. Victime de l'opportunisme de Mendoza, qui avait négocié son exil si la tempête ne frappait pas, la prêtresse choisit de fuir lâchement la cité et de se ranger du côté des Seibans.
Le lendemain, ayant constaté le départ d'Omuro, la Reine remercie les enfants et apprend, grâce à Tao, comment celle-ci procédait pour prédire la pluie. Soudain Paola alerte toute la tribu : les Seibans, accompagnés d'Omuro, sont sur le point d'attaquer la Cité. Esteban remarque que le Grand Condor pourrait les aider à les repousser. Mais comment le faire redécoller ? Tao suggère d'emprunter le miroir de la Reine et de s'en servir pour réfléchir la lumière du Soleil sur l'oiseau d'or. La Reine accepte et tous prennent la route du fleuve, armés du Miroir de la Lune. Paola parvient habilement à fournir au Grand Condor l'énergie solaire requise, et l'oiseau reprend aussitôt son envol. Lancé à pleine vitesse, Esteban réussit à faire chavirer tous les canots des Seibans et donne ainsi la victoire aux Amazones. Du ciel, tous s'adressent de chaleureux adieux.
Esteban et ses amis reprennent ainsi la route du nord, vers de nouvelles aventures ...